作為除菌對象，除菌過濾器本身在保護設備和介質免受細菌等影響時需要定期消毒。根據不同的使用條件和時期，滅菌通常每周或每月進行一次或兩次，每次約30分鐘。

　　眾所周知，殺菌過濾器的主要工作結構是微濾濾芯。當防止空氣中含有有害物質時，空氣應該從外向內流經濾芯。此外，除多芯過濾器外，滅菌過濾器為落地式，通常采用交叉懸掛式，有水平進出口。

　　為了科學使用滅菌過濾器，延長其使用壽命，在使用滅菌過濾器時，進入其中的壓縮空氣需要經過三級精密過濾器和干燥器，去除的油、水、灰塵和油霧的濃度應≤0.01PPM，以保證良好的滅菌效果。

　　為了在滅菌過程中達到優異的滅菌效果，有必要在滅菌操作之前測試一次過濾器的完整性，以確保過濾器的完美效果。